Фамилия Себеханова — редкий случай в русском ономастиконе, где прозрачная основа наталкивается на неочевидную географию. Сразу слышится тюркский корень «себех» или «сабах» — утро, рассвет, начало дня. В татарском, башкирском, казахском языках слово «саба» (или «себе») может означать и «утро», и «заря». Фамилию могли образовать от прозвища Себехан — «утренний хан», «владыка рассвета». Звучит торжественно, но в реальности такое имя-пожелание давали ребёнку, родившемуся на заре, или человеку, который вставал раньше всех.

Суффикс -ов- типичен для русской модели фамилий, но женская форма Себеханова указывает, что мужской вариант — Себеханов. Это значит, что предок носителя фамилии носил имя или прозвище Себехан. Встречаются и параллельные формы без суффикса — Себеханов мог появиться и как русифицированный вариант тюркской фамилии Себеханлы или Себеханулы, где русское окончание просто заменило родовой аффикс.

По географии фамилия тяготеет к регионам с татарским и башкирским населением — Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье, а также к Северному Кавказу, где встречаются кумыкские и ногайские корни. В дореволюционных метрических книгах Себехановы чаще записаны как государственные крестьяне или мещане, реже — как купцы. Дворянской ветви не прослеживается: основа «хан» в фамилиях простых сословий — не указание на знатность, а дань традиции давать детям имена с «хан» для защиты от злых духов.

Спорный момент — возможная связь с арабским «сабаха» (красота, прелесть). Если принять эту версию, Себехан — «красивый господин», но она менее убедительна: в тюркских языках «сабах» как «утро» встречается чаще, а суффикс -хан именно в утреннем контексте даёт логичное прозвище для раннего птахи. В любом случае, фамилия остаётся редкой: в современных базах данных её носителей — не более нескольких сотен человек по всей России.