Фамилия Себергер — нечастая в русском контексте, и её происхождение лежит за пределами славянской ономастики. Это типичная немецкая или скандинавская фамилия, и её разбор стоит начать с конечного элемента -гер, который восходит к немецкому Berg — «гора» или «холм». Вторая часть, Зебер-, скорее всего, происходит от немецкого See — «озеро». Таким образом, буквально фамилия означает «озерная гора» или «гора у озера». Это указывает на топографическое прозвище: предок носителя фамилии, вероятно, жил у холма или горы, расположенной рядом с озером.

Модель образования типична для немецких фамилий, возникших из названий местности. Суффикс -ер в конце основы — это распространённый формант, который в немецком языке часто указывает на принадлежность к месту или занятию (сравните Bäcker — пекарь). Однако здесь он не является отдельным суффиксом в русском понимании, а входит в состав сложного слова. Фамилия могла закрепиться за человеком, переселившимся из местности с таким названием, или за тем, кто жил у приметного холма над озером.

Встречается ли Себергер в России? Да, но как редкая фамилия, принесённая немецкими колонистами, которые селились в Поволжье, на юге Украины и в Причерноморье в XVIII–XIX веках. В документах того времени фамилия могла записываться с вариациями: Зебергер, Зеебергер или даже Зеберг. В немецком языке написание Seeberger — более распространённое, а форма Seberger — его сокращённый или диалектный вариант.

С точки зрения социальной истории, носители этой фамилии в Российской империи чаще всего были крестьянами-колонистами или ремесленниками. Дворянского происхождения у неё нет — это фамилия людей, чьи предки получили её по месту жительства. В современной Германии фамилия встречается, но не входит в число самых частых. Для русского уха она звучит непривычно, но её прозрачная этимология позволяет легко представить пейзаж, который дал ей начало: озеро и возвышенность на его берегу.