Фамилия Сечанкин образована от прозвища Сечанка. В основе этого прозвища лежит глагол «сечь» — рубить, рассекать, бить розгами. Суффикс -анк- в русских прозвищах встречается нечасто, но он придаёт слову оттенок предметности или орудийности: Сечанка — это либо человек, который сечёт (например, палач или дровосек), либо некий инструмент для сечки (топор, сечка, тяпка). Впрочем, прозвища на -ка часто давали по характерному действию: «Сечанка» мог получить мастер, рубивший капусту, или же человек с резким, рубленым характером.

Фамилия оформлена по модели с суффиксом -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — сын Сечанки. Это типичная патронимическая фамилия, распространённая среди крестьян и посадских людей. Суффикс -ин, в отличие от -ов, чаще встречается у фамилий, образованных от основ на -а/-я.

Стоит отметить и возможную связь с географическими названиями. В России есть несколько рек и ручьёв с названием Сеча, Сечанка — например, в бассейне Дона. В таком случае фамилия могла закрепиться за выходцем с берегов такого водоёма. Но эта версия менее вероятна: прозвищная основа встречается чаще, чем топонимическая.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Сечкин, Сеченов, Сечков — показывает, что у всех них общий смысловой центр: «сечь». Но Сечанкин стоит особняком из-за редкого суффикса -анк-. Эта модель больше характерна для украинской и белорусской традиции (ср. фамилии Шапранко, Гайданка), что может указывать на южнорусское или западнорусское происхождение рода.

По сословному составу Сечанкины, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками. Дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не отмечено. Встречаемость фамилии сегодня невысокая, в основном в центральных и южных областях России.