Фамилия Сеиев — одна из тех, где внешняя простота скрывает неочевидный корень. На первый взгляд она похожа на отчества от имени Сей, но такого имени в русских святцах нет. Всё дело в суффиксе -ев, который указывает на происхождение от личного имени или прозвища, оканчивающегося на мягкий согласный или «й». Основа «Сеи-» в русской ономастике чаще всего восходит к тюркскому имени Сей, Сейит (арабское «саййид» — господин, потомок пророка). В дореволюционной России так называли уважаемых людей, особенно в татарской, башкирской, казахской среде. Фамилия Сеиев, таким образом, означает «сын Сея» или «потомок Сеита».

Вторая, менее распространённая версия связывает фамилию с диалектным глаголом «сеять» или прозвищем Сея — так могли назвать крестьянина, занимавшегося посевными работами. Но эта гипотеза слабее: прозвище от глагола обычно давало форму Сеев (с одной «и»), а не Сеиев. Двойное «и» в корне как раз характерно для тюркских заимствований, где имя Сейит при адаптации теряло конечный согласный, но сохраняло гласный звук.

Географически фамилия встречается в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в регионах, где исторически жили татары и башкиры. В русских переписях XVIII–XIX веков носители фамилии Сеиев записаны среди государственных крестьян и мещан. Сословной элиты среди них не было: это фамилия, возникшая в низовых слоях общества, где имя Сей давали без связи с аристократическим происхождением, а скорее как традиционное.

С точки зрения словообразовательной модели фамилия типична для тюрко-русского пограничья: тюркское имя + русский патронимический суффикс -ев. Аналогично строились фамилии Ахмеев, Назиев, Рахиев. Если искать родственную фамилию, то ближайшая — Сеитов, где сохранён конечный согласный основы, но суффикс уже -ов. В русской среде фамилия редкая, в списках 500 самых частых фамилий России она не значится.