Фамилия Сеилис — редкий случай в русском ономастиконе. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная или искусственно оформленная. Скорее всего, она принадлежит к числу фамилий, образованных от личного имени или прозвища, но в иноязычной среде.

Наиболее вероятное происхождение — балтийское или немецкое. В литовском и латышском языках есть основа «seilis» или «seilis», означающая «сила», «крепость» или «здоровье». Фамилии с похожим звучанием (Seilis, Seilys) встречаются в Литве и Латвии. Если предок носителя фамилии был выходцем из Прибалтики, то Сеилис могло быть либо патронимом (сын Сеилиса), либо прозвищем, данным сильному или здоровому человеку. Вариант с немецким корнем тоже возможен: «Seil» по-немецки — «верёвка», «канат», и фамилия могла возникнуть как прозвище канатчика или торговца верёвками.

На русской почве фамилия сохранила исходное написание, что говорит о позднем появлении — скорее всего, в XIX — начале XX века, когда в Российскую империю активно переселялись прибалтийские немцы, литовцы и латыши. Встречается она редко, и в дореволюционных справочниках почти не зафиксирована. В советское время могла быть русифицирована ударением или окончанием, но в исходном виде осталась у тех семей, которые держались за первоначальную форму.

Словообразовательная модель проста: фамилия представляет собой чистую основу без суффикса, что типично для литовских и латышских фамилий мужского рода. Окончание -ис указывает на именительный падеж в литовском языке. Таким образом, Сеилис — это фамилия, которая практически не изменилась при переносе в русский язык, и её носители, скорее всего, имеют прибалтийские корни, а не славянские.