Фамилия Секушенко звучит как типичная украинская, и анализ её подтверждает это. Она образована по продуктивной восточнославянской модели при помощи суффикса -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок» (сравните с русскими фамилиями на -ов/-ев). Основа фамилии — Секуш- — восходит к прозвищу Секуш, которое, в свою очередь, связано с глаголом «секти» (сечь, рубить). Таким образом, первый носитель фамилии был, скорее всего, сыном человека по прозвищу Секуш.

Прозвище Секуш могло иметь несколько значений. Самое прямое — ремесленное: так могли назвать человека, занятого рубкой, например, дровосека или мясника (того, кто «сечёт» туши). В диалектах украинского языка слово «сікуш» или «сікач» могло обозначать и бойкого, резкого в движениях человека, а также того, кто любит «сікти» — спорить, рубить сплеча. Встречается и более узкое значение: так в некоторых регионах называли человека, делающего сечки (корм для скота из соломы). Вероятнее всего, прозвище носило профессиональный характер, указывая на род занятий предка.

С точки зрения географии, фамилия Секушенко наиболее характерна для центральных и восточных областей Украины (Полтавщина, Черкащина, Сумщина), а также для южных регионов, куда шла активная миграция в XVIII–XIX веках. В России она встречается реже и, как правило, связана с переселенцами с Украины. Интересная деталь: в русских переписях фамилию могли записывать на слух, отсюда возможны варианты «Секошенко» или «Сикушенко», но исходная форма сохраняет украинское «е» под ударением.

В отличие от многих фамилий на -енко, образованных от крестильных имён (Иваненко, Петренко), Секушенко стоит в ряду прозвищных фамилий, которые прямо говорят о характере или занятии предка. Это делает её более «прозрачной» для этимолога, но не менее интересной. Социальный состав носителей в XIX веке был почти исключительно крестьянским и казачьим — среди реестров казаков Запорожской Сечи и Войска Донского встречаются однофамильцы с похожей основой.