Фамилия Сеоеша — редкий случай в русском ономастиконе, где написание почти полностью скрывает исходное звучание. Скорее всего, перед нами искажённая при записи фамилия, возникшая на стыке культур. Её основа — не славянская, а, вероятно, финно-угорская или тюркская, что типично для северных и поволжских территорий России, где при переписях и в документах чужие имена записывали на слух, часто теряя и меняя звуки.

Если отбросить русский суффикс принадлежности -ев, который фамилия получила при адаптации (как Иванов или Петров), остаётся корень «Сеош». Он не имеет прямого значения в русском языке. Наиболее правдоподобная версия — происхождение от коми-зырянского или удмуртского личного имени или прозвища. В языках коми есть слово «сё» — «сто», и «ош» — «бык» или «медведь» (в разных диалектах). Сочетание «Сёош» могло означать «Сотня быков» или «Сто медведей» — прозвище богатого скотовода или удачливого охотника. В тюркских языках похожая основа «сео» встречается реже, но могла быть вариантом имени «Сеит» или «Сейит» (господин, потомок пророка), которое при записи в русских канцеляриях получило неожиданное окончание.

Особенность фамилии — её «немая» буква «ё» в начале. В старых документах её могли писать как «Сеоев», а позже, при смене орфографии, буква закрепилась, но не изменила произношения. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Сео́еша. Фамилия почти не встречается за пределами нескольких районов Республики Коми и Кировской области, что подтверждает её локальное, северное происхождение. Носители фамилии — потомки крестьян или охотников, чьё родовое прозвище записали с ошибкой, которая со временем стала официальной.