Фамилия Сэпман — редкий случай, когда написание почти полностью выдает происхождение. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые заканчиваются на -ов, -ев, -ин или -ский, здесь мы видим иноязычный суффикс -ман. В русской ономастике это почти всегда указание на немецкое, еврейское (ашкеназское) или прибалтийское происхождение. В данном случае наиболее вероятна немецкая или еврейская основа.

Первая часть, «Сэп», скорее всего, восходит к немецкому личному имени Sepp — краткой форме от Йозеф (Joseph). В немецких диалектах, особенно в Баварии и Австрии, «Зепп» — это обиходное, почти прозвищное обращение к человеку по имени Йозеф. Вторая часть, «ман» (Mann), переводится как «человек» или «мужчина». Таким образом, Сэпман — это «человек Зеппа» или «человек Йозефа», то есть фамилия, образованная по модели патронима (по имени отца или хозяина). Такая модель типична для немецких фамилий: Schmidt, Müller, Hoffmann — и здесь же Seppmann.

Есть и другая, менее вероятная версия. Если фамилия имеет еврейские корни (ашкеназские), то она могла возникнуть как искусственная или «декоративная» фамилия, данная чиновниками при паспортизации в XIX веке. В этом случае «Сэп» могло быть искажением немецкого слова Saft («сок») или просто случайным сочетанием звуков. Однако версия с личным именем Йозеф выглядит гораздо убедительнее — она проще и естественнее для бытовой ономастики.

В России фамилия Сэпман встречается крайне редко. Её носители — это, как правило, потомки немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или еврейских семей из черты оседлости. Географически фамилия может быть связана с Поволжьем (где были немецкие колонии) или с западными губерниями. Из-за редкости фамилия не обросла устойчивыми легендами или громкими историческими фигурами — это типичный случай, когда этимология ясна, а биография конкретных предков остается за кадром.