Фамилия Сергушина — женская форма фамилии Сергушин, и её разговорный суффикс -ин сразу указывает на способ образования: от имени или прозвища отца, оканчивающегося на -а или -я. Основа здесь — Сергуша.

Сергуша — это просторечная, уменьшительно-ласкательная форма мужского крестильного имени Сергий. В народе это имя произносили как Сергей, а от него пошли бесчисленные «домашние» варианты: Сергун, Сергуня, Сергуша. Суффикс -уш- в данном случае не столько уменьшительный, сколько обиходный, характерный для северных и центральных русских говоров. Именно такие формы часто закреплялись в фамилиях, потому что в быту человека называли не полным именем, а уличным прозвищем — Сергуша.

Фамилия Сергушины могла закрепиться за крестьянами или посадскими людьми. В отличие от фамилий на -ский, которые нередко выдавали дворянское или духовное происхождение, фамилии на -ин (как и на -ов) были самой массовой моделью в России: их носили от 60 до 70 процентов населения. Поэтому Сергушины — это, скорее всего, потомки простого человека по имени Сергей, которого в деревне звали Сергушей.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и северо-востоку Европейской России. В переписных книгах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне Сергушины в Нижегородском уезде и Вятской губернии — регионах, где суффикс -уш- в личных именах был особенно употребителен.

Стоит отметить, что в основе фамилии лежит не редкое, а одно из самых частых русских имён, поэтому Сергушины — не уникальная, но вполне устойчивая фамилия. Её главная особенность — сохранение той самой ласкательной формы, которая в официальных документах почти не встречалась, зато прочно жила в народной речи.