Фамилия Сергушенко — один из характерных примеров украинской модели фамилии на -енко, которая в XVII–XVIII веках распространилась по всей Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко в этой системе означал «сын» или «потомок»: Сергушенко — буквально «Сергушин сын». Исходное имя — Сергуша, уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Сергий (в бытовом русском и украинском произношении — Сергей). Формант -енко здесь стоит не сразу за корнем, а за суффиксом -уш-, что придаёт фамилии оттенок особой нежности или принадлежности к младшему поколению: Сергушенко — «сын того, кого звали Сергуша».

Основа Сергуш- встречается и в других восточнославянских фамилиях: Сергушин, Сергушев, Сергун, Сергунов. Но именно с суффиксом -енко фамилия прочно связана с территорией современной Украины, особенно с Полтавщиной, Черниговщиной и Харьковщиной. В российских переписях и метрических книгах Сергушенко встречается редко — это маркер украинского происхождения рода.

Стоит разобрать и вторую версию, менее вероятную, но упоминаемую в любительской ономастике: будто бы Сергушенко происходит от прозвища Сергуша, которое могло быть связано с диалектным «серга» — серьга или кольцо. Однако в этом случае ожидались бы формы вроде Сергушенко от прозвища Сергун (человек с серьгой). Но имя Сергий — основа настолько распространённая и надёжная, что версия с серьгой не выдерживает критики.

Социально фамилия Сергушенко не указывает на дворянское происхождение. Как и большинство фамилий на -енко, она возникла в среде казачества, крестьянства и мещанства. В реестрах Запорожского войска и исповедных росписях XVIII века люди с такой фамилией — рядовые казаки или посполитые. Никаких громких исторических деятелей с фамилией Сергушенко не известно, что делает её типичной для своего региона: это «фамилия-отчество», которая в каждом роду возникала независимо.

Таким образом, если ваша фамилия Сергушенко, ваши предки, скорее всего, происходят из украинских земель, а родоначальником был человек по имени Сергуша — сын, внук или правнук Сергея.