Фамилия Сергушкина образована от обиходной формы старинного русского имени Сергушка — так в быту звали человека, носившего крестильное имя Сергей, или, по-церковнославянскому произношению, Сергий. Уменьшительно-ласкательный суффикс -ушк- придавал имени оттенок теплоты и близости: так могли называть и ребёнка, и взрослого в кругу семьи или среди соседей. Потомок человека по имени Сергушка со временем получил фамилию Сергушкина.

Модель образования здесь простая и древняя: к имени отца или деда добавляли притяжательный суффикс -ин, который отвечал на вопрос «чей?». Сергушкина буквально означала «дочь или жена Сергушки». Такая схема типична для русских фамилий, но важно обратить внимание на окончание: форма Сергушкина, а не Сергушкин, указывает на то, что перед нами женский вариант фамилии либо фамилия, закрепившаяся за женщиной как главой семьи или вдовой.

Скорее всего, основатель рода Сергушкиных был человеком из простого сословия. Фамилии на -ин в крестьянской и посадской среде встречались повсеместно, а вот дворянские роды чаще носили фамилии на -ов или -ский. Имя Сергушка не было редким, но и не принадлежало к самым распространённым: оно встречалось в документах XVI–XVII веков, особенно в северных и центральных русских землях. В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или ремёсел, Сергушкина напрямую связана с личным именем, поэтому восстановить её исходный смысл проще: она не описывает характер или занятие предка, а просто называет его по имени.

Стоит добавить, что однокоренные фамилии — Сергушков, Сергушин, Сергушев — возникали из тех же обиходных форм имени Сергей, но с разными суффиксами. Сергушкина выделяется именно ласкательным -ушк-, который в фамилиях встречается реже, чем -ин или -ов, и потому звучит заметно мягче и «домашнее». Сегодня фамилия не принадлежит к числу массовых, но и не является исчезающе редкой: она встречается в разных регионах России, без ярко выраженной привязки к одной местности.