Фамилия Сесекина хранит память о прозвище дальнего предка — Сесека. В его основе лежит редкий глагол «сесекать», который в старых говорах означал «шепелявить, сусыкать, говорить с, з вместо ш, ж». Проще говоря, так называли человека, который картавил или не выговаривал часть звуков. Чаще всего такое прозвище закреплялось за ребенком, который дольше других не мог освоить правильное произношение, и оставалось с ним на всю жизнь как домашнее, а затем и уличное имя.

Прозвище Сесека перешло в фамилию по типичной для русских фамилий модели: к основе добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Сесекин, то есть сын, потомок Сесеки. Такой способ словообразования был самым распространенным в центральной России, поэтому фамилия звучит по-крестьянски просто и естественно. Со временем форма Сесекин закрепилась за родом, а в женском варианте — Сесекина.

Интересно, что прозвище это не оскорбительное, а скорее описательное: в деревнях к речевым особенностям относились с юмором и без злобы, поэтому подобные именования встречались часто. Родственные фамилии — Сюсюкин, Шепелев, Сысоев (от другого корня) — образованы по тому же принципу: за основу брали заметную черту человека.

Сведения о носителях фамилии встречаются в документах XX века. Например, в записях упоминается Владимир Ефимович Сесекин, родившийся в 1902 году. Такие архивные следы подтверждают, что фамилия бытовала в реальной жизни, а не осталась только в устной традиции. Сегодня Сесекины — редкая фамилия, и это делает её ещё более ценным маркером семейной истории: за ней стоит конкретное прозвище, живой говор и характер конкретного человека, жившего несколько поколений назад.