Фамилия Сейбанова — женская форма мужской фамилии Сейбанов. Её основа — прозвище или тюркское имя Сейбан. Чтобы понять происхождение, стоит разобрать это слово.

Самая вероятная версия: Сейбан — это вариант имени Сайфан, которое восходит к арабскому «сайф» — «меч». В тюркских языках, особенно у народов Поволжья и Северного Кавказа, звук «ф» часто заменялся на «б» или «п». Так имя Сайфан превращалось в Сейбан. Суффикс «-ан» в арабских именах может указывать на уменьшительную или ласкательную форму. Таким образом, Сейбан — это «меч» или «меченосец» в переносном, уважительном смысле.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с тюркским словом «сейбан» — «погонщик скота», «пастух». В этом случае прозвище давали по роду занятий. Однако первая версия выглядит правдоподобнее, так как фамилии от арабских имён с корнем «сайф» (Сайфуллин, Сайфутдинов) широко распространены у татар и башкир, а Сейбанов встречается реже, что указывает на локальную фонетическую особенность.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Сейбан добавили патронимический суффикс «-ов», означающий принадлежность («чей?» — Сейбанов). То есть предок носителя фамилии был сыном человека по имени или прозвищу Сейбан.

Географически фамилия Сейбанов (и Сейбанова) чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Это подтверждает её тюрко-арабские корни и связь с исламской традицией имянаречения. Сословного барьера у неё не было: носителями могли быть и крестьяне, и служилые татары. В дореволюционных записях фамилия фиксируется с XIX века.