Фамилия Сейдалина — женская форма, а её мужской вариант — Сейдалин. Основа фамилии — мужское имя Сейдал, которое встречается у тюркских народов, в первую очередь у казахов. Скорее всего, Сейдал — это стяжённая форма от более полного имени Сейдалы (или Сейдалла), где первая часть «сей» восходит к арабскому «саййид» — господин, повелитель, потомок пророка. Вторая часть — «дал» или «далы» — может означать «плечи», «спина» в переносном смысле «опора», «защитник». Таким образом, имя Сейдал могло пониматься как «благородная опора» или «господин-защитник».

Фамилия образована по тюркской модели: к имени Сейдал прибавили русский патронимический суффикс -ин, который у восточных славян указывал на принадлежность: «чей?» — Сейдалин, то есть сын Сейдала. В казахской среде такие фамилии нередко закреплялись в XIX–XX веках, когда при переходе на оседлость и паспортный учёт к родовым именам добавляли русские окончания. Это отличает Сейдалина от исконно русских фамилий с тем же суффиксом: там основа чаще была прозвищем или мирским именем, а здесь — арабско-тюркское личное имя с религиозным оттенком.

Географически фамилия тяготеет к Северному Казахстану и Оренбургской области России, где исторически жили казахи Младшего жуза. Встречается она и у татар, но реже. Спорных версий происхождения почти нет: корень прозрачен, и альтернативные гипотезы (например, от топонима Сейдал в Дагестане) маловероятны, так как фамилия почти не зафиксирована на Кавказе.

Социальный контекст прост: предки носителя фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а само имя указывает на уважение в роду — его давали в честь авторитетного старшего или по религиозной традиции. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла писаться с «ъ» на конце — Сейдалинъ, а в советских документах закрепилась современная форма.