Фамилия Сейсенбекова — одна из тех, что сразу указывает на казахские корни и на то, что её носительницы — женщины. Мужской вариант этой фамилии — Сейсенбеков. В отличие от русских фамилий, где суффиксы -ов/-ев или -ин чаще привязаны к отцу или деду, в казахской ономастике модель образования прямая: к личному имени Сейсенбек добавляется окончание, указывающее на родственную связь. В русском языке это окончание превратилось в -ов/-ова по аналогии с фамилиями крещёных народов, но основа осталась тюркской.

Имя Сейсенбек составное. Первая часть — «Сейсен» — восходит к арабскому «санис» или «сани», что означает «второй» или «похвала». В казахской традиции так могли назвать второго сына в семье, либо дать имя в честь дня недели (среда по-тюркски «сейсенби»). Вторая часть — «бек» — классический тюркский титул, означающий «господин», «князь», «правитель». В составе имён этот компонент указывал на знатное происхождение или на пожелание, чтобы мальчик вырос уважаемым и властным человеком. Соединение «Сейсен» и «бек» даёт значение «второй господин» или «похвальный князь», но в бытовом смысле это просто личное имя, данное ребёнку, а не указание на реальный социальный статус.

Фамилия Сейсенбекова распространена прежде всего в Казахстане, особенно в южных и западных областях. В России она встречается редко, в основном среди потомков казахов, переехавших в советское время. Поскольку фамилия образована от личного имени, а не от прозвища или ремесла, её носители не принадлежали к какому-то одному сословию: среди Сейсенбековых могли быть и скотоводы, и ремесленники, и позже — учителя, врачи, инженеры. В советский период, когда в Казахстане активно формировались фамилии по русскому образцу, окончание -ова закрепилось за женщинами, а -ов — за мужчинами, что и отличает эту фамилию от, скажем, казахских фамилий на -улы или -кызы.

Любопытно, что в казахском языке ударение в фамилии Сейсенбекова падает на последний слог — на «ва», как и в большинстве заимствованных русских окончаний. В русском произношении ударение часто смещается на второй слог — Сейсéнбекова, что меняет звучание, но не смысл. Если искать однокоренные фамилии, то это Сейсенов (без «бек»), Сейсенбаев или Сейсенгалиев — все они образованы от того же имени «Сейсен» с разными суффиксами и компонентами. По сути, Сейсенбекова — это точное указание на то, что предок по мужской линии носил имя Сейсенбек, и эта фамилия не таит в себе загадок: она прозрачна для тех, кто знаком с казахской антропонимией.