Фамилия Шабалдыгин — один из тех случаев, где за неблагозвучной для современного уха основой стоит живое прозвище, а не искажённое имя. Вопреки возможной догадке, корень здесь не связан с «шабашом» или чем-то нечистым. Скорее всего, в основе лежит диалектное слово «шабалда» или «шабалдыга». В говорах русского севера и центральной России так называли болтуна, пустомелю, человека, который говорит много и бестолково, «треплет языком». Второе значение, более редкое, — неопрятный, растрёпанный человек, неряха. В любом случае, прозвище Шабалдыга давалось не в комплимент, а по заметной черте характера или внешности.

Суффикс «-ин» в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — Шабалдыгин, то есть сын Шабалдыги. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. Если бы основа звучала как Шабалда, мы бы имели Шабалдин, но форма «Шабалдыга» с суффиксом -ыг- (как «бродяга», «растяпа») дала более редкую и колоритную фамилию.

Примечательно, что фамилия имеет ограниченный ареал. По данным исторических переписей, основные гнёзда Шабалдыгиных — в бывших Вятской и Пермской губерниях, а также в Костромской области. Это подтверждает, что прозвище бытовало именно в северных и северо-восточных русских говорах. Встречается и вариант Шабалдыкин — с другим суффиксом, но той же корневой семантикой.

В ономастических словарях фамилию иногда сближают с тюркским словом «шабалды» (шум, гам) или даже с именем Шабал (вариант Шабан). Но эти гипотезы слабее: во-первых, суффикс -ыг- нехарактерен для тюркских заимствований в русских прозвищах, во-вторых, география фамилии (северные регионы с минимальным татарским влиянием) говорит в пользу исконно русского происхождения от диалектного слова. Так что предок современного Шабалдыгина, скорее всего, был заметным говорливым человеком в своей деревне на Вятке или под Костромой.