Фамилия Шагтдинов — одна из тех, что не встречается на каждом шагу, но её происхождение прослеживается достаточно чётко. Она тюркская по корню и русская по форме: типичный фамильный суффикс -ов указывает на то, что перед нами «сын» или «потомок» человека, которого звали Шагтдин.

Основа фамилии — мужское личное имя Шагтдин. Это вариант имени Шагитдин, которое, в свою очередь, восходит к арабскому «шахид» (свидетель) и «дин» (вера). В буквальном переводе — «свидетель веры». В исламской традиции это имя нередко давали с пожеланием, чтобы человек был стойким в своей вере. Под влиянием местных диалектов и особенностей произношения в татарской, башкирской или казахской среде звук «ги» мог редуцироваться, и имя закрепилось как Шагтдин.

Словообразовательная модель здесь простая: к основе Шагтдин прибавили русский патронимический суффикс -ов, который в среде крещёных татар или при оформлении документов в Российской империи был стандартным способом русификации фамилий. То есть предок носителя фамилии, вероятнее всего, был татарином или башкиром, носившим имя Шагтдин, а его дети уже стали писаться Шагтдиновыми.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской и Челябинской областям. Встречается она нечасто, что говорит о сравнительно небольшом роде или о позднем оформлении фамилии. Одно из отличий от более распространённых однокоренных вариантов (например, Шагитдинов или Шахитдинов) — именно усечённая форма «Шагт», которая могла возникнуть в речи как быстрое произношение без промежуточного гласного.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к служилым татарам. Дворянских корней у этой фамилии нет, что типично для поздних патронимических фамилий, возникших в XVIII–XIX веках, когда крестьянам и мещанам массово присваивали фамилии по отцу.