Фамилия Шаихмурзин — яркий пример тюрко-арабского именослова, адаптированного русской фамильной моделью. В её основе лежит составное личное имя Шаихмурза. Первая часть, «Шаих» (от арабского «шейх»), означает старейшину, почтенного человека, главу рода или духовного наставника. Вторая часть, «Мурза», — тюркский титул, восходящий к персидскому «мирза» (сын эмира). В русской истории XVI–XVII веков мурзами называли татарских князей и знатных людей. Таким образом, полное имя Шаихмурза можно перевести как «почтенный господин» или «князь-шейх» — имя с явным указанием на высокий социальный статус.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Шаихмурзин — «сын Шаихмурзы» или «из рода Шаихмурзы». Это типичная русская патронимическая модель, которая прирастала к тюркским именам в XVI–XIX веках, когда татарская знать и служилые люди переходили на русскую фамильную систему. В отличие от фамилий на «-ов/-ев», суффикс «-ин» чаще присоединялся к основам, оканчивающимся на гласный или мягкий согласный, что и произошло в данном случае.

Фамилия Шаихмурзин — редкая и географически привязанная. Основные очаги её бытования — Татарстан, Башкортостан и Оренбургская область. Это указывает на происхождение от служилых татар или башкир, которые несли сторожевую службу на юго-восточных рубежах России. Встречаются варианты написания: Шаихмурзов (с другим суффиксом) или Шайхмурзин, что связано с особенностями произношения в разных диалектах. Однофамильцы с корнем «Шаих-» (Шаихов, Шаиханов) образуют гнездо, объединённое общим арабским корнем, но Шаихмурзин стоит особняком благодаря редкой двухкорневой основе.