Фамилия Шахмуратов образована от мужского тюркского имени Шахмурат. Первая из них восходит к имени Шах, которое в переводе с персидского означает «хан, повелитель; владелец, хозяин». Таким образом, потомок человека, которого звали Шахмурат, со временем получил фамилию Шахмуратов.