Фамилия Шакидский — один из тех случаев, когда форма на -ский не указывает на польское или украинское происхождение, а скорее прячет за собой тюркское имя. Основа фамилии — «Шакид» — восходит к арабскому имени Шахид (شهيد). В классическом исламе шахид означает «свидетель», но в бытовой и исторической традиции это имя нередко толковали как «мученик за веру» или «павший за правду». Имя Шахид, а в просторечии Шакид, было распространено у татар, башкир и других тюркоязычных народов, исповедующих ислам.

Суффикс -ский в русской ономастике чаще всего маркирует дворянские или шляхетские фамилии, образованные от названий поместий. Но в случае Шакидского механизм иной. Скорее всего, фамилию дали по отцу: Шакид + -ский. Такая модель встречалась в среде крещёных татар и представителей тюркской служилой знати, которые переходили на русскую фамильную систему в XVI–XVII веках. То есть Шакидский — это не «владелец села Шакиды», а «сын Шакида», оформленный по польско-русскому образцу.

Географически фамилия редкая. Основной ареал — Поволжье и Южный Урал, особенно Татарстан, Башкортостан и Оренбургская область. Встречается она и у русских, но почти всегда с татарскими или башкирскими корнями в родословной. В дореволюционных метрических книгах можно найти Шакидских среди мещан и государственных крестьян, реже — среди купцов. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шакидов и Шахидов встречаются гораздо чаще. Форма на -ский — более книжная, возможно, её носитель или его предок был грамотным человеком: муллой, писарем, учителем. В этом смысле фамилия Шакидский может говорить не столько о происхождении, сколько о социальном статусе её первого носителя — человека, который выбрал для записи фамилию по «благородному» образцу.