Фамилия Шакклеина — редкая, и её происхождение неочевидно. В русском языке нет устоявшейся основы «шаккле-», поэтому ключ к разгадке — в окончании и возможной иноязычной природе корня.

Суффикс -ин прямо указывает на модель образования от имени или прозвища, оканчивающегося на -а/-я: Шакклея → Шакклеин → Шакклеина (женская форма). Это типичная «притяжательная» фамилия, отвечающая на вопрос «чей?» — то есть «дочь (или жена) Шакклеи».

Самого имени Шакклея в православных святцах нет. Скорее всего, основа — иноязычная. Наиболее вероятна немецкая или голландская версия. Фамилия Шаккле (Schackle, Schakle) или Шаккель (Schackel) встречается в немецкоязычных областях. В таком случае русское окончание -ин добавилось при адаптации, когда немца-колониста или специалиста на русской службе называли «Шакклей», а его потомков — Шакклеиными. Само немецкое слово «Schackel» (от «Schake») в диалектах могло означать «цепь», «звено» или быть прозвищем кузнеца, ковавшего такие цепи.

Вторая, менее вероятная версия — финно-угорская. В карельском и вепсском языках встречаются фамилии с похожим звучанием, образованные от личных имён, например, Shakkeli. Однако суффикс -ин в таком случае нехарактерен для автохтонных фамилий Севера, где чаще встречаются -ов/-ев.

Таким образом, носитель фамилии Шакклеина с большой долей вероятности происходит из семьи обрусевших немцев или голландцев, чей предок носил прозвище или фамилию Шаккле (возможно, по ремеслу, связанному с цепями или скобами). Географически фамилия могла закрепиться в регионах компактного проживания немецких колонистов — Поволжье, Петербургская губерния или юг Украины.