Фамилия Шаклунова — женская форма фамилии Шаклунов, а её основа — прозвище или нецерковное имя Шаклун. Разберём эту нечасто встречающуюся фамилию с точки зрения словообразования и возможного происхождения.

Ключ к пониманию — суффикс -ун, который в русских фамилиях и прозвищах указывает на деятеля, носителя характерного признака или действия. Такие прозвища были распространены в северных и центральных говорах. Сама основа «шакл-» имеет несколько версий, и самая правдоподобная связана с глаголом «шакать» или «шаковать», что в диалектах означало «шататься», «слоняться без дела», «бродить». Соответственно, Шаклун — это человек, который «шакает», то есть бродяга, шатун, или, в более мягком смысле, непоседа. Суффикс -ун усиливает именно эту деятельную, активную характеристику (сравните: крикун, бегун, ворчун).

Менее вероятная, но возможная версия — связь со словом «шакал» через искажённое «шакл». Однако в русской ономастике прозвища от названий животных обычно образуются напрямую (Волк, Лиса, Заяц), и форма с суффиксом -ун для этого нетипична. Поэтому версия с «шатуном» выглядит убедительнее.

Географически фамилия Шаклунов встречается в основном на Русском Севере и в Сибири — регионах, куда уходили вольные или беглые люди, где прозвища вроде «шатун» были особенно живучи. Встречается она и в Забайкалье, что может указывать на старообрядческие корни носителей.

Таким образом, предок современной Шаклуновой — скорее всего, не оседлый крестьянин с постоянным наделом, а человек с подвижным образом жизни: охотник, бродячий ремесленник или просто тот, кого в деревне прозвали за непоседливый нрав Шаклуном. Фамилия сохранила эту диалектную черту, которая сегодня почти утрачена в литературном языке.