Фамилия Шакунас — наглядный пример того, как география и язык предков могут быть зашифрованы в окончании. В русском языке она звучит непривычно, и причина проста: перед нами не исконно русская фамилия, а литовская, оформленная по модели литовских фамилий. Типичное литовское окончание -ас (в мужском роде) или -айте/-уте (в женском) здесь редуцировалось до -ус, что характерно для адаптации литовских фамилий в русской среде. Полная исходная форма — Šakūnas.

Основа фамилии — литовское слово šaka, что значит «ветвь». Соответственно, Šakūnas — это «ветвистый» или «тот, кто связан с ветвями». В литовской ономастике суффикс -ūnas часто указывал на принадлежность, происхождение или характерный признак. Так могли прозвать человека с раскидистой, густой шевелюрой, похожей на ветви, или того, кто жил у разветвления дорог, на перекрёстке. Реже — мастера, работавшего с ветками, лозой, прутьями (например, плетельщика корзин или изгородей).

Встречается и версия, что в основе лежит не šaka, а диалектное šakas — «сук», «сучковатый». Тогда прозвище могло быть дано человеку с грубым, неуживчивым характером или физическим недостатком (например, с кривыми пальцами, похожими на сучья). Но первая трактовка — через «ветвь» — считается основной и более благозвучной.

Географически фамилия Шакунас сосредоточена на северо-западе России, в регионах, граничащих с Литвой и исторически связанных с Великим княжеством Литовским: Калининградская, Псковская, Ленинградская области. В самой Литве фамилия Šakūnas встречается, но не является массовой. В России носители — потомки литовских переселенцев, часто крестьян, которые в XIX веке переезжали в более свободные земли или были переселены в ходе аграрных реформ.

Интересная деталь: в русских документах фамилия могла записываться как Шакунас, Шакун, а иногда и с окончанием -ов — Шакунов. Последняя форма — результат русификации, когда литовское окончание отбрасывали или заменяли на русский патронимический суффикс. Поэтому, если в архивах встречается Шакунов, это, скорее всего, тот же корень, но уже полностью адаптированный к русской фамильной системе.