Фамилия Шаликиани — одна из тех, что сразу выдают грузинское происхождение. Её выдают два маркера: характерный суффикс -иани и конечное ударение, которое в русском языке часто смещается, но в оригинале падает на последний слог. Формант -иани в грузинской ономастике — один из самых распространённых, он указывает на принадлежность к роду, месту или предку. По сути, это патронимический суффикс, который можно перевести как «из рода такого-то» или «принадлежащий такому-то».

Основа «Шалик» — это, скорее всего, уменьшительная или обиходная форма от личного имени. В грузинском языке есть мужское имя Шалико, которое, в свою очередь, является народной формой от Шалва или Шали. Само имя Шалва восходит к персидскому «шах» (царь) с грузинским суффиксом -ва. Получается, что Шаликиани — это «потомок Шалико» или «из дома Шалико». Фамилии на -иани особенно типичны для восточной Грузии, прежде всего для Кахетии и Картли, где такие родовые прозвания складывались уже в позднем Средневековье.

В русской передаче фамилия закрепилась в форме Шаликиани, хотя в грузинском написании она выглядит как შალიკიანი. Иногда встречается вариант с одним «и» — Шаликани, но это скорее искажение при записи в советских паспортных столах. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые чаще указывали на отца, грузинский формант -иани мог обозначать не только прямого предка, но и основателя рода, жившего несколько поколений назад. Поэтому носитель фамилии Шаликиани — не обязательно сын Шалико, а скорее его дальний потомок, чей род вёл начало от человека с этим именем.

Сословная принадлежность у этой фамилии не зафиксирована в общих справочниках. В Грузии фамилии на -иани носили и князья, и крестьяне — суффикс сам по себе не указывает на знатность. Однако в Кахетии, откуда происходит большинство таких фамилий, многие Шаликиани были либо свободными крестьянами, либо мелкими дворянами (азнаури). Точных данных о численности носителей нет, но фамилия не относится к массовым — скорее, к редким, локальным, что говорит о её происхождении из одного небольшого села или ущелья.