Фамилия Шалонкина — женская форма, мужской вариант — Шалонкин. Её основа, скорее всего, связана с географическим названием или прозвищем, а не с популярными в русской ономастике именами-канонами вроде Иван или Пётр.

Корень «Шалон-» отсылает к нескольким возможным источникам. Первый и самый очевидный — топонимический. Шалон — историческое название города Шалон-ан-Шампань во Франции (Châlons-en-Champagne). В древнерусской письменности и в документах XVI–XVII веков это название встречается в форме «Шалон», «Шалонь». Выходцы из этого региона, попавшие на Русь (например, купцы, военные или ремесленники), могли получить прозвище Шалон, от которого и пошла фамилия. Правда, таких случаев известно немного, и фамилия остаётся редкой.

Вторая версия — прозвищная, от слова «шалон» в значении «шерстяная ткань» (французское «chalon»). В старину шалоном называли плотное сукно, которое везли из Западной Европы. Торговца этой тканью или портного, шившего из неё, могли прозвать Шалоном. Суффикс -кин (-ин) указывает на принадлежность: «чей?» — Шалонкин, то есть сын или потомок Шалона. В русской модели фамилий на -ин обычно стоят прозвища или имена, оканчивающиеся на -а, -я, но здесь основа на твёрдый согласный — случай нестандартный, что говорит о позднем или диалектном закреплении формы.

Третья, менее вероятная гипотеза — связь с диалектным глаголом «шалонить» (озорничать, баловаться). Но тогда ожидалась бы фамилия Шалонкин от прозвища Шалонка (женского рода), что маловероятно для прозвища мужчины. Скорее всего, в основе лежит именно прозвище Шалон, а суффикс -кин возник по аналогии с фамилиями типа Фомин, Ильин.

Фамилия Шалонкина не входит в число распространённых. Встречается в основном в центральных областях России, а также в Поволжье — это может указывать на миграцию носителей из торговых городов. Сословная принадлежность предков неясна: это могли быть и крестьяне, и мещане, и купцы — однозначных данных нет. Важно, что фамилия не имеет отношения к дворянским родам и не фиксируется в старых боярских списках.

Таким образом, Шалонкины — потомки человека, которого либо называли по месту происхождения (из Шалона), либо по роду занятий (торговец сукном). Обе версии правдоподобны, но первая выглядит более конкретной, хотя и редкой для русской среды.