Фамилия Шалпакова — женская форма, а её мужской вариант, Шалпаков, образован по стандартной русской модели с суффиксом -ов, указывающим на принадлежность («чей?»). Основа здесь — прозвище или именование Шалпак. Разбор упирается в тюркские корни, и это не случайно: фамилия характерна для народов Северного Кавказа и Поволжья, особенно для кумыков, ногайцев и татар.

Самая вероятная версия связывает Шалпак с тюркским словом «шалпак» (или «чалпак») — «плоский», «расплющенный», «широкий и приплюснутый». В тюркских языках это слово могло описывать внешность человека, например, широкое лицо или приплюснутый нос. Такие прозвища по физическим чертам — частый источник фамилий: предка могли прозвать Шалпаком за характерную форму головы или фигуру.

Вторая, менее распространённая версия отталкивается от диалектного значения: у некоторых тюркских народов «шалпак» — это вид лепёшки или плоское блюдо. В этом случае прозвище мог получить пекарь или любитель такой еды. Однако прозвища по еде обычно давали в насмешку, а не по профессии, поэтому эта гипотеза слабее.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на второй слог (Шалпа́ков), так и на последний (Шалпако́в) — это зависит от местной диалектной нормы. В русской передаче фамилия сохранила тюркское звучание, но обросла типичным русским окончанием, что говорит о давней ассимиляции носителей в русскоязычной среде. Суффикс -ов здесь не указывает на дворянство или крестьянство — это обычная модель, закрепившаяся в XIX веке при массовой записи фамилий в метрические книги.

Сравните с однокоренными фамилиями: Чалпаков, Шалпаков, Шалбаков — все они восходят к тому же корню, различаясь лишь диалектным произношением. Встречается фамилия и у казахов, где форма Шалпаков может быть русифицированным вариантом от казахского «шалпақ» (плоский, широкий). Таким образом, предки носителей фамилии Шалпакова — скорее всего, тюркоязычные люди, получившие прозвище по внешности, а затем ставшие частью русского сословного общества.