Фамилия Шамсеева — одна из тех, что прямо указывает на восточные корни, чаще всего татарские или башкирские. Её основа — мужское имя Шамсе́й (вариант Шамси́), которое восходит к арабскому «шамс» — солнце. В мусульманской традиции имя Шамси (или Шамсуддин) означает «солнце веры», «солнце религии», что делало его популярным и уважаемым. Женская форма фамилии образована от мужской Шамсеев через типичный русский суффикс -а, указывающий на принадлежность к роду.

Словообразовательная модель проста: тюркское имя Шамсей + русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкой основы). Такое сочетание характерно для фамилий, которые возникли в среде крещёных татар или народов Поволжья, принявших православие. В документах XVI–XVII веков нередко встречаются записи вроде «Иван Шамсеев сын» — это означало, что отца звали Шамсей, а сын уже носил русифицированное отчество, которое позже закрепилось как фамилия.

Географически фамилия Шамсеева распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах, где веками жили тюркские народы. Встречается она и среди казанских татар, и среди мишарей. Интересно, что ударение в фамилии может падать как на второй слог (Шамсе́ева), так и на первый (Ша́мсеева) — это зависит от местной диалектной традиции произношения имени-основы.

В отличие от фамилий на -ин, которые чаще указывают на прозвище или род занятий, Шамсеева — это чисто именная фамилия, «сын (или дочь) Шамсея». Социальный контекст её возникновения — скорее всего, среда рядовых служилых татар или крестьян, которые при переходе в православие сохраняли родовое имя как фамилию. В дворянских родословных эта фамилия почти не встречается.

Если ваш предок носил фамилию Шамсеева, то, вероятнее всего, он происходил из волжско-татарской среды, а его далёкий предок носил имя, связанное с солнечным символом и религиозным почитанием. Никакой тайны или неоднозначности в этимологии нет — это прозрачный случай адаптации восточного имени через русскую патронимическую систему.