Фамилия Шамши — редкий случай, когда географический и языковой следы ведут не в глубь России, а на юг и восток. Скорее всего, перед нами не славянская, а тюркская или иранская фамилия, и её происхождение напрямую связано с личным именем Шамши.

В основе фамилии лежит арабское имя Шамс (солнце), которое в тюркских языках приобрело форму Шамши («мой солнечный»). Это имя было распространено среди татар, башкир, азербайджанцев, а также народов Средней Азии. Встречается оно и в иранском мире — в персидском языке «шамши» может означать «солнечный», «сияющий». Таким образом, фамилия Шамши — это патроним, образованный от личного имени отца: «сын (или потомок) Шамши». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, здесь нет привычного фамильного суффикса, что характерно для тюркских и кавказских ономастических моделей.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с арабским словом «шамш» (сирийский). В этом случае Шамши могло быть прозвищем человека, торговавшего с Сирией или имевшего сирийские корни. Однако эта гипотеза слабее: прозвища по этнониму обычно закрепляются в более узнаваемых формах (например, Сириец), а Шамши чаще встречается именно как имя.

Фамилия Шамши — одна из тех, что не вписывается в привычную схему русских фамилий. Она не «крестьянская» и не «дворянская» в классическом понимании, а скорее указывает на восточные корни носителя. Учитывая ареал бытования имени Шамши, предки носителя фамилии могли быть выходцами из Поволжья (татары), Закавказья или Средней Азии. Встречается фамилия и у горских евреев, где имя Шамши также зафиксировано.