Фамилия Шанникова — женская форма от мужской Шанников, и её разбор стоит начать с суффикса -ов, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Шанников, то есть потомок или человек из рода Шанника. Основа здесь — не имя и не географическое название, а прозвище или профессиональное именование Шанник. Что оно означало?

Самый прямой и вероятный путь — от слова «шан» или «шань». В русских говорах «шань» — это искажённое «сан» (высокий чин, положение), но чаще так называли человека, который что-то «шанит» — то есть шутит, балагурит или, в некоторых диалектах, занимается пустяками, бездельничает. В ономастике есть фамилии Шанин, Шанов, они образованы от той же основы. Прозвище Шанник мог получить весельчак или человек, склонный к шуткам, — отсюда и фамилия.

Вторая, менее распространённая версия связывает фамилию с тюркским корнем «шан» (слава, почёт). Учитывая, что фамилия оканчивается на -ов, а не на -ин, и встречается в центральных и южных регионах России, где были контакты с тюркскими народами, такое толкование возможно, но менее убедительно: прозвища от тюркских корней чаще давали по конкретным качествам или занятиям, а «слава» — слишком общее понятие.

Интересная деталь: в некоторых областях России «шанником» могли называть мастера, изготавливающего шани — род открытых пирожков или лепёшек (сравните с «шаньга»). Если это так, то предок носительницы фамилии мог быть пекарем или поваром, специализировавшимся на этом блюде. Однако эта версия остаётся гипотетической — прямых упоминаний «шанника» как ремесленника в исторических словарях нет.

Фамилия Шанникова не относится к числу массовых. Она редкая, и это говорит о том, что её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных родов. Встречается в основном на Урале и в Поволжье — регионах, где активно смешивались русские, финно-угорские и тюркские языки. Сословно предки могли быть крестьянами или мещанами: фамилии на -ов у простых людей закрепились в XVIII–XIX веках, и Шанниковы не исключение.