Фамилия Шарапинский — редкий случай в русской ономастике, где за основу взято не имя, не профессия и не характер, а топоним, причём с нетипичным для славянских земель корнем. Её носитель — выходец из населённого пункта с названием Шарапин, Шарапино или Шарапинка. Такие селения встречаются в основном на территории современной Украины и юга России, и их название, скорее всего, восходит к тюркскому личному имени Шарап (от арабского «шараф» — честь, достоинство) или же к прозвищу, связанному с тюркским словом «шарап» (вино, напиток). Таким образом, предок Шарапинского мог быть либо переселенцем из деревни, основанной человеком с именем Шарап, либо, что менее вероятно, потомком винодела или торговца вином.

Суффикс -ский в этой фамилии — классический признак дворянского или шляхетского происхождения, но в данном случае он, скорее всего, выполняет чисто географическую функцию: «тот, кто родом из Шарапина». В XIX веке такие фамилии часто присваивались семинаристам или крестьянам, переехавшим в город и взявшим фамилию по месту прежнего жительства. Важно отметить, что фамилия Шарапинский не имеет отношения к фамилии Шарапов (от имени Шарап) или к слову «шарап» в значении «бесплатно» — это разные корни, которые лишь случайно звучат похоже.

Окончание на -инский вместо более распространённого -овский указывает на то, что название поселения имело форму притяжательного прилагательного: «Шарапин» (например, «хутор Шарапин»). Такая модель характерна для южнорусских и украинских говоров. Фамилия остаётся локальной и не получила широкого распространения за пределами исторических Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний. Если искать её корни в документах, стоит обратить внимание на метрические книги сёл с корнем «Шарап-» в этих регионах.