Фамилия Шарденков образована от прозвища или нецерковного имени Шардень. Основа здесь — слово «шарда», которое в русских говорах имело несколько значений. В вятских и пермских говорах так называли мелкую, рассыпчатую ледяную крупу, что-то вроде снежной пыли или изморози. Человека могли прозвать Шардень за бледность, мелкое телосложение или, наоборот, за резкий, «колючий» характер. Менее вероятна связь с тюркским корнем, где «шарда» означало «пёстрый» или «рябой», — в этом случае прозвище указывало бы на внешность, например, веснушки или следы оспы.

Суффикс -енк- в основе Шарденков — уменьшительный, характерный для севернорусских и сибирских фамилий. Он придаёт прозвищу оттенок «малый Шардень», то есть сын или потомок человека с таким прозвищем. Сама фамилия строится по типичной отческой модели: Шарденко → Шарденков, то есть «сын Шарденка». Это роднит её с фамилиями вроде Иванченков, Мироненков, где суффикс -енк- сначала присоединялся к основе, а потом наращивался стандартный -ов.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России. По данным переписей XIX века, Шарденковы встречались в Вятской губернии (особенно в Слободском и Глазовском уездах), а также в Пермской губернии. Это согласуется с диалектным значением слова «шарда» — именно в тех краях оно бытовало. В центральных губерниях фамилия редка, что подтверждает её локальное происхождение.

В социальном плане Шарденковы — скорее всего, крестьянский род, вышедший из государственных или бывших монастырских крестьян. Фамилии на -енков в этой среде нередко фиксировались в ревизских сказках как «прозвания» целых семей, а не отдельного человека. Таким образом, Шардень мог быть прозвищем основателя династии, которое закрепилось за его потомками.

Спорных версий немного. Иногда фамилию пытаются связать с французским «Шарден» (фамилия художника), но это натяжка — русская фамилия с таким корнем появилась задолго до моды на всё французское, и её носители не имели отношения к дворянству или искусству. Более правдоподобно, что Шарденков — чисто русская фамилия, возникшая в среде северных крестьян и сохранившая в основе местное диалектное слово.