Фамилия Шарифканова — женская форма от мужской фамилии Шарифканов. Её основа — составное арабо-персидское имя Шарифкан. Первая часть, «шариф», в переводе с арабского означает «благородный», «знатный», «высокородный». В исламской традиции так называли потомков пророка Мухаммада, но в быту имя Шариф давали и просто с пожеланием почёта и уважения. Вторая часть, «кан», — тюркский компонент, восходящий к слову «хан» (правитель, владыка). Таким образом, Шарифкан — это «благородный хан» или «знатный правитель», имя-пожелание, типичное для татаро-башкирской антропонимии.

Фамилия образована по русской словообразовательной модели с суффиксом -ов, который в тюркоязычной среде Поволжья и Приуралья стал универсальным способом русификации фамилий. Суффикс -ин здесь не появился, хотя основа заканчивается на согласный, — это указывает на то, что фамилия складывалась в более поздний период, когда -ов уже вытеснил -ин как стандартный патронимический формант для всех основ. Изначально Шарифканов — это «сын Шарифкана», то есть типичная отчество-фамилия, закрепившаяся в документах после переписи населения.

Географически фамилия тяготеет к татарским и башкирским регионам: Татарстан, Башкортостан, а также к смежным областям — Оренбургской, Челябинской, Самарской. Встречается она редко, что говорит о локальном распространении: вероятно, родоначальник был заметным человеком в своей деревне или волости, раз его имя с титульной частью «хан» легло в основу фамилии. В дореволюционной России носители такой фамилии относились к сословию государственных крестьян или тептярей, реже — к купечеству, но не к дворянству, поскольку фамилия не имеет княжеского суффикса -ский и не фиксируется в родословных книгах.

Любопытная деталь: у фамилии Шарифканов есть параллельная форма Шарифханов, где вторая часть записана через «х» — это более точная передача исходного «хан» в арабской графике. Форма на «к» (Шарифканов) могла возникнуть под влиянием русского произношения, где сочетание «фх» неудобно для выговора, и «х» перешло в «к». Обе формы встречаются у татар, и их носители в прошлом могли быть однофамильцами из одного рода, чьи фамилии разошлись на письме из-за неграмотности писарей XIX века.