Фамилия Шаяков — редкий случай, когда происхождение почти наверняка не связано с русским языком, а корни ведут на восток. В основе лежит личное имя Шая, которое в тюркских и кавказских языках является краткой формой от Шаяхмет, Шаяли, Шаян и тому подобных. Первая часть таких имён восходит к персидскому «шах» — «господин», «владыка», а вторая — к арабскому «ахмад» (самый хвальный) или другим компонентам. Таким образом, имя Шая — это усечённый вариант сложносоставного имени, которое давали с пожеланием благородства и силы.

Стандартный русский суффикс -ов указывает на принадлежность: Шаяков буквально значит «сын Шаи», «потомок Шаи». Фамилия оформлялась по русской модели при взаимодействии народов — татар, башкир, народов Кавказа — с русской административной системой, особенно после введения всеобщих переписей и паспортизации в XIX веке. Поэтому Шаяковы — это, скорее всего, обрусевшие потомки тюркского или кавказского рода.

Главная особенность этой фамилии — её региональная привязанность. Если верить доступным статистическим данным, Шаяковы встречаются в основном в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области и в Чечне. Второй вариант происхождения, хоть и менее вероятный, — от тюркского слова «шай» (чай) или «шая» (радость, веселье). Прозвище Шая могли дать чаеводу, любителю чая или жизнерадостному человеку, но имя-основа остаётся главной версией.

Фамилия не имеет никакого отношения к еврейскому имени Шая (Исайя) — это параллельная, но другая традиция. В русском контексте Шаяков — яркий пример того, как восточное имя получило славянское оформление, сохранив при этом этническую память о предке-основателе.