Фамилия Шаймаер — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не славянское, а немецкое или еврейское (ашкеназское). В основе лежат два немецких корня: «Schön» (красивый, прекрасный) или «schon» (уже) и «Meier» (управляющий, арендатор, фермер). Второй вариант — сложение «Schay» (искажённое от «Schön») и «Maier». Таким образом, фамилия могла означать «красивый управляющий» или, если принять вариант с «schon», «уже управляющий» — но первая версия правдоподобнее.

Модель образования — типичная для немецких составных фамилий, где две основы слились в одно слово без суффиксов. На русской почве фамилия могла появиться через переселение немцев в Российскую империю в XVIII–XIX веках (при Екатерине II) или через еврейские общины, где нередко брали немецкие фамилии при переходе к оседлости. Вариант написания «Шаймаер» — это русифицированная транскрипция немецкого «Schönmaier» или «Schaymaier». Встречаются и другие формы: Шаймайер, Шейнмайер.

В славянской среде фамилия не могла возникнуть естественным путём: нет ни русского корня «шай», ни суффикса «-маер». Поэтому её носители — потомки немецких колонистов, поволжских или причерноморских, либо еврейских семей, живших в черте оседлости. Географически фамилия редкая, но фиксируется в документах по Одесской области, бывшим немецким колониям на Волге, а также в Прибалтике. В современной России встречается единично, чаще в крупных городах — как след миграций XX века.

Социальный контекст: предки-носители фамилии Шаймаер были, скорее всего, арендаторами или управляющими хозяйствами (Meier), что в немецких колониях считалось статусной, но не аристократической профессией. Дворянской фамилия не была — это фамилия крестьян или ремесленников, хотя отдельные ветви могли получить выслуженное дворянство за службу. Точных данных о сословной принадлежности без генеалогического поиска нет, но круг сужается до двух основных групп: немецкие колонисты и еврейские общины.