Фамилия Шаймухамбетов — яркий пример исламского ономастикона, адаптированного русской грамматикой. Её основа — сложное мужское имя Шаймухамбет, где первая часть «шай» восходит к арабскому «шайх» (старейшина, предводитель, почтенный человек), а вторая — «мухамбет» — один из вариантов произношения имени Мухаммед (восхваляемый, прославляемый). Таким образом, имя Шаймухамбет буквально означает «почтенный Мухаммед» или «старейшина Мухаммед».

Модель образования типична для тюркских фамилий, попавших в русскую среду: к имени Шаймухамбет добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Шаймухамбета). Ударение, скорее всего, падает на предпоследний слог: Шаймухамбе́тов, хотя в разговорной речи возможны колебания.

Географически фамилия почти наверняка связана с Казахстаном и прилегающими регионами. Форма «Мухамбет» характерна для казахского произношения имени Мухаммед (в отличие от татарского «Мухаммат» или башкирского «Мөхәммәт»). Поэтому предки носителей фамилии — казахские мусульмане, получившие фамилию в XIX — начале XX века, когда Российская империя начала фиксировать «инородческое» население по отчеству. Сын человека по имени Шаймухамбет записывался как Шаймухамбетов.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий, образованных от имени пророка (Мухаммедов, Мухаметшин), здесь мы видим составное имя с эпитетом «шайх». Это говорит о том, что первый носитель имени, вероятно, пользовался особым уважением в общине — либо как духовное лицо, либо как аксакал. Фамилия не указывает на конкретное ремесло или сословие, но однозначно маркирует этническое и религиозное происхождение рода.