Фамилия Шаймухаммедов — яркий пример того, как тюркские и арабские корни переплелись в русской антропонимии. Она образована от мужского имени Шаймухаммед, которое, в свою очередь, является сложносоставным. Первая часть «шай» (от арабского «шайх» или тюркского «шай») означает «старейшина», «предводитель», «почитаемый человек». Вторая часть — имя пророка Мухаммеда. Таким образом, имя Шаймухаммед можно перевести как «почтенный Мухаммед» или «старейшина, подобный Мухаммеду».

Фамилия построена по классической русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Шаймухаммедов, то есть сын или потомок Шаймухаммеда. Такая модель стала массовой в Российской империи среди крещёных или принявших православие народов Поволжья, Урала и Кавказа, но она же закрепилась и у мусульманских народов, когда им нужно было официально оформить фамилии в XIX–XX веках.

В отличие от многих русских фамилий, которые произошли от прозвищ или профессий, Шаймухаммедов — чисто патронимическая фамилия, напрямую от личного имени. Это сближает её с типичными фамилиями татар, башкир, казахов и других тюркских народов, где имя отца становилось наследственным. Предок носителя фамилии, скорее всего, был уважаемым человеком в своей общине, раз получил такое составное имя.

Интересно, что в некоторых тюркских языках встречается вариант написания через «х» — Шаймухаммедов, а в русской транскрипции иногда путают «Шай» и «Шах», хотя это разные корни. Вариант «Шахмухаммедов» означал бы «царь Мухаммед» — тоже возможная, но отдельная фамилия. У Шаймухаммедовых корень явно тяготеет к «старшинству», а не к «царской власти». Географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахских и узбекских диаспор, где распространены имена с компонентом «Мухаммед».