Фамилия Шаюнусова — яркий пример того, как тюркское имя, попав в русскую среду, обросло славянским суффиксом и закрепилось в документах. Её основа — мужское личное имя Шаюнус, которое представляет собой местный, диалектный вариант арабского имени Юнус (библейский Иона). В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, начальное «Й» часто переходит в «Ж» или «Ш», а «с» на конце — характерный признак именительного падежа в некоторых диалектах. Таким образом, Шаюнус — это тот же Юнус, но произнесённый по законам народной фонетики.

Модель образования проста и типична для Поволжья и Приуралья: к основе Шаюнус добавили русский патронимический суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Фамилия буквально означает «дочь (или жена) Шаюнуса». Такая схема — тюркское имя плюс -ов/-ев — в XIX веке массово фиксировалась у татар, башкир, мишарей и других народов региона при переходе к постоянным фамилиям. Мужской вариант — Шаюнусов.

Фамилия редкая и географически привязана. Её носители почти наверняка родом из Татарстана, Башкортостана или Оренбургской области. Встречаемость низкая, что говорит о происхождении от одного конкретного предка по имени Шаюнус, а не от распространённого прозвища. Этот предок мог быть крестьянином, ремесленником или муллой — имя Юнус (Иона) почитается в исламе как имя пророка, так что религиозный подтекст у основы есть. Сословная принадлежность, скорее всего, была крестьянской или мещанской: дворянские тюркские фамилии чаще оформлялись через -ский или -ин, а не через -ов.

В отличие от фамилий на -ев, где основа часто оканчивается на мягкий согласный (например, Юнусов), здесь твёрдый суффикс -ов указывает на то, что исходное имя в бытовой речи произносилось как Шаюнус с твёрдым «с». Это важная деталь для тех, кто ищет корни: если в документах встречается вариант Шаюнусов, он первичен, а женская форма Шаюнусова — вторична и возникла при регистрации женщин или вдов.