Фамилия Щеббаков — редкий случай, когда внешний облик слова обманчив. На первый взгляд, здесь просматривается типичная русская модель «основа на твёрдый согласный + суффикс -ов», указывающая на принадлежность к отцу или хозяину. Однако корень «щеббак» в литературном русском языке отсутствует, и это заставляет искать объяснение в диалектах, искажениях или профессиональных прозвищах.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «щебень» — мелкий битый камень, используемый в строительстве и для отсыпки дорог. В таком случае «Щеббак» — это прозвище человека, занятого добычей, дроблением или перевозкой щебня. Суффикс -ак в русских говорах часто придаёт слову значение деятеля: «рыбак» (тот, кто ловит рыбу), «гуляка» (тот, кто гуляет). Соответственно, «щеббак» — это работник на щебёночном карьере или дорожный рабочий. Удвоенная буква «б» в написании — позднее явление, возможно, связанное с желанием сохранить произношение твёрдого «щ» или с влиянием редких диалектных форм (сравните: «щебень» в некоторых говорах звучал как «щебба»).

Менее правдоподобна, но допустима версия о происхождении от тюркского корня. В татарском и башкирском языках есть слово «чебәк» (чепрак, попона для лошади), которое в русской передаче могло превратиться в «щебак» или «щеббак». Однако такая гипотеза слаба: во-первых, фамилия не встречается в регионах с плотным тюркским населением, во-вторых, переход «ч» в «щ» для русских фамилий нехарактерен, если только это не результат смешения говоров.

С географической точки зрения Щеббаковы — фамилия локальная. Основной массив носителей зафиксирован в центральных и южных областях России, где издавна велась добыча известняка и строительного камня (Тульская, Липецкая, Воронежская области). Это косвенно подтверждает версию о связи с профессией: именно в этих местах щебёночные карьеры были распространены.

Сословное происхождение фамилии определить сложно из-за редкости. Скорее всего, Щеббаковы — потомки государственных или помещичьих крестьян, занятых в несельскохозяйственных промыслах. В дворянских родословных книгах эта фамилия не упоминается, что типично для прозвищ, образованных от ремесла. В любом случае, Щеббаков — это не переосмысленное крестильное имя, а именно прозвище по занятию, которое со временем закрепилось в качестве родового имени.