Фамилия Шеборонин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с диалектным глаголом. Она образована по продуктивной модели с суффиксом -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Шеборонин, то есть сын или потомок Шеборона.

Ключ к разгадке — слово «шеборон» или «шеборыга». В северных и сибирских говорах «шебороном» называли неопрятного, лохматого человека, неряху. Глагол «шеборшить» означал «ерошить, взлохмачивать, делать неаккуратным». Вероятно, прозвище Шеборон дали человеку с растрёпанными волосами или неряшливой одеждой. Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным «шебор» (шум, возня), тогда прозвище могло относиться к суетливому, беспокойному человеку.

Фамилия редкая и географически привязана к центральным и северным областям России, особенно к Вятке и Пермскому краю, где говоры сохранили слово «шеборон». Встречается она и в вариантах Шеборыгин, Шеборшин — все они однокоренные и восходят к тому же диалектному гнезду.

Сословного барьера у фамилии не было: прозвища такого типа давали и крестьянам, и мещанам. Однако в силу «неблагозвучного» значения (неряха) в высшие слои общества она не проникла. Носители Шеборониных — это, скорее всего, потомки крестьян или ремесленников из северных губерний, где прозвище закрепилось как фамильное имя.