Фамилия Шечкина — женская форма от Шечкин, и её происхождение ведёт к прозвищу или имени Шечка. Основа здесь — не очевидная «щека», а скорее всего, вариант имени Шестак или Шестой, что в старину часто давали шестому ребёнку в семье. В русских говорах «шечка» могло быть уменьшительно-ласкательной формой от «шест» или «шестой», а фамилии на -ин образовывали от основ, оканчивающихся на -а или -я: Шечка → Шечкин.

Менее вероятная, но встречающаяся версия связывает фамилию с диалектным «шечка» — так в некоторых областях называли щеку или скулу, а прозвище Шечка мог получить человек с заметными скулами или круглолицый. Однако в ономастике такие прямые телесные аналогии редко оказываются основными, если есть более логичное числовое объяснение.

Географически фамилия Шечкин встречается в центральных и северных областях России — в Вологодской, Костромской, Ярославской губерниях, где были сильны традиции прозвищ от порядковых чисел. В переписных книгах XVII века упоминаются крестьяне Шечкины в окрестностях Устюга, что подтверждает северное происхождение.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду — «чей?» — Шечкин, то есть сын или потомок Шечки. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от названий профессий или животных, -ин здесь держится за личное прозвище.

Спорных версий немного: иногда фамилию пытаются связать с тюркским словом «шек» (князь, господин), но это натяжка — для русских фамилий такая основа нетипична, да и ареал бытования Шечкиных не совпадает с зонами тюркского влияния. Правдоподобнее держаться числового корня: предки носителя фамилии, скорее всего, были шестыми детьми в семье и получили соответствующее прозвище, которое со временем закрепилось как фамильное имя.