Фамилия Шеенский — редкий случай, когда географическое прозвище почти наверняка перевесило личное имя. Скорее всего, её основатель получил фамилию по названию места, где жил или откуда был родом. Самый прямой кандидат — река Шеень, приток Десны, протекающая по Смоленской и Брянской областям. На ней стоит деревня Шеенка (бывшая Шеень), и житель этой местности легко мог стать Шеенским. Модель образования прозрачна: суффикс -ск- типичен для польской и западнорусской шляхты, а затем закрепился в русских фамилиях как указание на «княжеское» или «дворянское» происхождение, хотя со временем его получили и крестьяне.

Есть и вторая, менее очевидная версия — от прозвища Шея. В старину «шея» могла означать не только часть тела, но и, например, узкий проход, перешеек. Человек с длинной или короткой шеей получал прозвище Шея, а его потомки — Шеин (самая частая форма) или Шеенский. Однако суффикс -енск- в этом случае выглядит искусственным: от «Шея» логичнее ждать Шеев или Шеин. Поэтому версия с рекой Шеень выглядит убедительнее, хотя и не исключает, что прозвище могло наложиться на уже существовавшую фамилию.

Интересно, что фамилия Шеенский практически не встречается в центральных губерниях России — её очаг находится на западе, в пограничье с Беларусью. Это косвенно подтверждает связь с конкретным топонимом: река Шеень протекает как раз в тех краях, где исторически смешивались русские, белорусские и польские фамильные модели. В документах XVII–XVIII веков носители такой фамилии могли быть мелкими служилыми людьми или однодворцами, а не боярами, — суффикс -ский в этой местности часто присваивался не за знатность, а по месту жительства.

В написании фамилии нет вариаций: Шеенский пишется с двумя «е» и окончанием -ий. Путаница возможна разве что с фамилией Шеинский, но это совсем другая история — от имени Шея или от слова «шеина». Если ваш предок носил фамилию Шеенский, скорее всего, его корни уходят в западнорусские земли, к берегам небольшой, но упомянутой в летописях реки.