Фамилия Шеферис — редкая и необычная для русского уха, и её происхождение напрямую связано с еврейской традицией именования. В основе лежит слово «шефер» (идиш שעפער, иврит שפר), что означает «красота», «благолепие», «прелесть». Суффикс -ис указывает на патронимическую модель, распространённую в среде ашкеназских евреев: он образует фамилии со значением «сын такого-то» или «принадлежащий такому-то». Таким образом, Шеферис — это «сын Шефера» или «потомок Красавца».

Исходное прозвище Шефер могли дать человеку с приятной внешностью, либо оно могло быть связано с женским именем Шефер (встречающимся в еврейских общинах). В отличие от славянских фамилий на -ов/-ев, где суффикс указывает на принадлежность отцу (Иванов — сын Ивана), ашкеназский суффикс -ис (а также -ес, -ович) выполняет ту же роль, но закрепляется в письменной форме, часто через немецкое или польское посредничество. Поэтому Шеферис — не переделка славянской фамилии, а самостоятельный продукт еврейской ономастики Восточной Европы.

Географически фамилия тяготеет к территориям бывшей черты оседлости: Украине, Белоруссии, Литве, а также к польским землям. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века Шеферис встречается редко, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в одной-двух общинах. Вариантов написания почти нет: в отличие от более частых фамилий, которые «гуляли» по документам (Шефер, Шеферман, Шеферович), Шеферис сохраняет стабильную форму, что указывает на позднюю фиксацию фамилии (вторая половина XIX века).

Социальный контекст: носители фамилии, скорее всего, были ремесленниками или мелкими торговцами, так как в еврейских местечках фамилии такого типа не несли сословной окраски. Отсутствие дворянских приставок (фон, де) и окончания -ский подтверждает, что это фамилия простого сословия. В современной России Шеферис — большая редкость, её можно встретить в основном у потомков эмигрантов из черты оседлости, сохранивших исходное написание.