Фамилия Шекитаева — редкая и с трудом поддающаяся однозначной этимологии. Её основа не лежит на поверхности, и здесь приходится выбирать между двумя разными языковыми пластами: тюркским и, менее вероятно, иранским (осетинским).

Проще всего разобрать фамилию по словообразовательной модели. Суффикс -ев указывает на русское оформление, характерное для фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или -й. Ударение, скорее всего, падает на третий слог: Шекита́ева. А вот корень Шекит- — главная загадка.

Первая и самая правдоподобная версия ведёт в тюркские языки. В них есть корень «шек» или «шик», который может означать «сомнение», «подозрение», но чаще — «изящный», «красивый», «нарядный» (сравните с турецким şık — «шикарный, элегантный»). В сочетании с аффиксом -ит (который может быть вариантом древнего тюркского суффикса принадлежности или уменьшительности) прозвище «Шекит» могло означать «щеголь», «франт», «человек, следящий за собой». В таком случае фамилия Шекитаева — это «потомок того, кого звали Шекит», то есть «принадлежащие Шекиту». Географически такие прозвища могли бытовать среди татар, башкир или народов Кавказа, испытавших тюркское влияние.

Вторая, более экзотическая версия, отсылает к осетинскому языку. В осетинском есть слово «сæкæт» (sækæt) — «корзина», «лукошко». Если предположить, что исходная форма звучала как «Сæкæт» или «Шекет», то прозвище могло относиться к корзинщику, торговцу корзинами или просто к человеку с характерной фамильной чертой. Однако переход «с» в «ш» в начале слова для осетинского нехарактерен, и эта гипотеза слабее тюркской.

Что касается социального контекста: фамилия недворянская, не княжеская. Окончание на -ев и отсутствие в исторических родословных книгах говорит о крестьянском или мещанском происхождении. В современных базах данных Шекитаевы встречаются единично — в основном на Северном Кавказе (Кабардино-Балкария, Ставропольский край) и в центральной России, что подтверждает версию о миграции с юга. Скорее всего, предок носителя фамилии получил прозвище Шекит за внешний вид или манеру одеваться, и это прозвище закрепилось за его потомками.