Фамилия Шеломянский — один из тех случаев, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Суффикс -ский указывает на дворянский или польский тип образования, но в реальности он чаще всего означал «выходец оттуда-то» или «владелец такого-то места». В основе здесь почти наверняка лежит топоним Шеломя, Шеломы или Шеломянск.

Самая прямая версия — связь с древнерусским словом «шелом» (шлем). В старой русской топонимике «Шеломя» — это не только «холм» или «возвышенность» (сравните с «шеломя» в «Слове о полку Игореве»), но и название урочищ, где когда-то стояли сторожевые курганы или укрепления. Сёла с названием Шеломы, Шеломинцы, Шеломя разбросаны по Смоленщине, Брянщине, Черниговщине. Человек из такого села получал прозвание Шеломянский, то есть «тот, кто с Шеломя». В польской традиции (ср. Szelomski) фамилия могла закрепиться за шляхтичем, владевшим фольварком Шеломы.

Менее вероятная, но встречающаяся в любительских генеалогиях версия — от прозвища Шеломя, которое давали воину, носившему шлем, или мастеру, делавшему шлемы (шеломники). Однако для фамилии на -ский прозвищный путь образования в русском крестьянском сословии нехарактерен: такие фамилии обычно давали либо по месту, либо при получении дворянства. Куда реалистичнее считать, что предок-крестьянин носил фамилию Шеломя (по месту жительства), а его потомок, перебравшись в город или вступив в духовное сословие, «облагородил» её суффиксом -ский. В семинарской среде это была частая практика.

В написании возможна путаница с фамилией Шеломенцев (от «шеломень» — холмистая местность) или Шеломов (от «шелом» — шлем). Но Шеломянский стоит особняком: его «полякующий» суффикс и редкая основа выдают либо западнорусские корни (современные Беларусь, Украина, западные области России), либо искусственное происхождение в духовном училище. Искать «родовое гнездо» стоит в бывших владениях Речи Посполитой или в Смоленской губернии — там фамилия встречается с XVIII века.