Фамилия Шемереко — редкий случай, когда географическая привязка оказывается почти такой же важной, как и этимология корня. Она отчетливо тяготеет к западноукраинским и польским землям, и это заметно по самой модели образования. Суффикс -ко (Шемере-ко) в украинской и белорусской ономастике — один из самых продуктивных: он оформлял прозвища и имена в уменьшительно-ласкательной или патронимической форме, указывая на «сына» или «потомка» человека с таким прозвищем. То есть носитель фамилии — это, скорее всего, «маленький Шемера» или «сын Шемеры».

Сам корень Шемер- неочевиден и вызывает споры. Наиболее правдоподобная версия связывает его с польским или украинским диалектным глаголом szemrać — «шептать», «бормотать», «роптать». В таком случае прозвище Шемера могли дать человеку неразговорчивому, говорящему тихо и невнятно, либо, наоборот, тому, кто постоянно был чем-то недоволен и ворчал себе под нос. В старых польских говорах szemrać имело оттенок «браниться вполголоса», что тоже хорошо ложится на характер прозвища.

Есть и более редкая, но возможная версия: от древнееврейского имени Шемер (в Библии — владелец горы Самария). Однако для фамилии, бытующей в славянской среде, эта гипотеза выглядит натянутой — вряд ли еврейское личное имя дало бы прозвище с типичным украинским суффиксом, не пройдя через дополнительное переосмысление. Поэтому первая версия (от szemrać) предпочтительнее, тем более что в польских фамилиях встречается прямой аналог — Szmer или Szemera.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Шеме́реко. Это типично для украинских фамилий на -ко с основой из трех слогов. Встречаются единичные носители фамилии в западных областях Украины (Львовская, Тернопольская), а также среди потомков эмигрантов в Аргентине и США. Фамилия редкая, не попала в крупные дореволюционные справочники, поэтому сословную принадлежность предков определить трудно — она могла быть у крестьян, мещан или мелкой шляхты, но без архивных записей это лишь догадки.