Фамилия Шептинський — яркий пример того, как топонимическая основа получает польский или украинский суффикс принадлежности -ськ(ий). В русском языке она часто адаптируется как Шептинский, но исходная форма с мягким знаком указывает на западнорусское или малороссийское происхождение. Суффикс -ськ(ий) в этой модели означает «выходец из» или «относящийся к» определённому месту. Соответственно, предок носителя фамилии был либо родом из села, либо владел землёй в местности, название которой послужило основой.

Корень «Шепт-» почти наверняка отсылает к гидрониму или названию поселения. На карте Украины и Польши встречаются речки и сёла с корнем «Шепт» или «Шепот» (например, Шепетовка). Вероятнее всего, фамилия образована от названия населённого пункта Шептичи, Шептиця или подобного. Первичное значение — «житель Шептина», то есть человека, происходящего из места с таким именем. Связь с глаголом «шептать» маловероятна, хотя и возможна как редкое прозвище: в говорах «шептун» могло означать не только тихо говорящего, но и знахаря, заговаривающего болезни. Однако топонимическая версия надёжнее, так как суффикс -ський в массе своей указывает на географическое происхождение.

Географически фамилия тяготеет к западным областям Украины и к приграничным районам Польши. В исторических документах Речи Посполитой встречаются шляхетские роды Шептицких (польск. Szeptycki), что указывает на возможное благородное происхождение части носителей. Однако не стоит думать, что все Шептинские — потомки знати: крестьяне, переселяясь из одного села в другое, часто получали фамилию по покинутому месту жительства. Таким образом, Шептинський — фамилия-указатель, которая говорит о том, откуда пошёл род, а не о занятии или внешности предка.