Фамилия Шепуленко — украинская по модели образования, что сразу видно по суффиксу -енко, который в XVI–XVIII веках был главным маркером потомка или сына (буквально «маленький», «сын такого-то»). В центральных и левобережных губерниях Малороссии фамилии на -енко носили казаки, мещане и крестьяне, так что дворянского происхождения здесь, скорее всего, нет.

Основа фамилии — Шепул- — вызывает вопросы, потому что прямого слова «шепул» в украинском языке нет. Самая вероятная версия: это фонетический вариант прозвища Шепель или Шепелявый. В украинских говорах мягкое «п» могло переходить в «п'», а конечное -л давало -ль, которое при русификации фамилий часто заменяли на твёрдое -л. Тогда Шепуленко — «сын Шепеля», то есть человека с шепелявой речью. Прозвища по дефектам речи давали часто и без насмешки — скорее как примету, чтобы отличить одного Ивана от другого.

Есть и более редкая гипотеза: связь с диалектным глаголом «шепелить» — не только говорить в нос, но и «шарить, рыться, делать что-то небрежно». В украинских сёлах так могли назвать неаккуратного работника или, наоборот, суетливого человека. Но эта версия слабее, потому что в письменных источниках фамилия Шепуленко встречается именно в тех регионах (Полтавщина, Черниговщина, Слобожанщина), где форма -енко была основной для казачьих родов, а шепелявость — самая частая причина подобных прозвищ.

Интересная деталь: фамилия Шепуленко — не единственная в этом гнезде. В тех же краях бытуют Шепель, Шепеленко, Шепелюк и Шепуляк. Все они восходят к одному корню, и разница в суффиксах показывает, как в разных сёлах один и тот же прозвищный предок дал начало разным ветвям рода. Если ваши предки — из Черкасской или Киевской области, возможно, фамилия писалась через «е» (Шепеленко), а со временем из-за аканья или ошибок писаря закрепилось «у». В метрических книгах XIX века такое смешение встречается сплошь и рядом, поэтому при поиске корней стоит проверять оба варианта написания.