Фамилия Шейгобутдинов — редкий пример, где в одной основе сплелись тюркское имя и арабский религиозный термин. Разбирать её стоит с конца: суффикс -ов указывает на русскую модель образования (принадлежность к роду), а корень — на восточное, скорее всего татарское или башкирское, происхождение.

Основа фамилии — составное имя Шейгобутдин. Первая часть, Шейго, — это искажённое или диалектное произношение арабского «шейх» (старейшина, духовный наставник). В тюркских языках, особенно в татарском, звук «х» на конце слова часто переходит в «г» или выпадает, поэтому «шейх» могло звучать как «шейг». Вторая часть — Бутдин — это вариант арабского имени Бахауддин или Бадруддин, где «баха» (красота, блеск) или «бадр» (полная луна) со временем в устной речи упростилось до «бут». Получается, что Шейгобутдин — это народная форма от «Шейх Бахауддин» или «Шейх Бадруддин», то есть «шейх, краса веры» или «шейх, полная луна веры».

Такое составное имя — типичный пример татаро-мусульманской антропонимии XVIII–XIX веков, когда к сакральному арабскому имени добавляли уважительный титул «шейх». Носитель фамилии — потомок человека, которого, вероятно, звали Шейгобутдин. Этот человек мог быть муллой, учителем при мечети или просто уважаемым старцем в своей деревне, поскольку титул «шейх» в народной среде нередко закреплялся за благочестивыми людьми без формального духовного сана.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречаются варианты написания Шайгобутдинов, где первая гласная «а» отражает более широкий (ойкающий) говор, или Шейхобутдинов — попытка вернуть исходный арабский звук «х». Фамилия редкая, в списках «100 самых распространённых татарских фамилий» её нет, что говорит о локальном бытовании, возможно, в пределах одного села или рода.

С точки зрения словообразования интересно, что суффикс -ов присоединился к полному имени, а не к усечённой основе (как, например, в фамилии Шейхов). Это указывает на относительно позднюю фиксацию фамилии — в XIX веке, когда в метрических книгах уже записывали «Шейгобутдинов сын», а не просто «Шейх». Других версий происхождения, кроме как от личного имени, у этой фамилии нет: ни географический объект, ни прозвище по ремеслу здесь не прослеживаются.