Фамилия Шибаланская — редкий случай, когда географическая привязка почти очевидна, а вот корень вызывает споры. Она образована по продуктивной модели с суффиксом -ск-, который в русских фамилиях чаще всего указывает на происхождение от географического названия. Основа здесь — топоним Шибалан или Шибаланы. Такое название могло принадлежать селу, деревне или урочищу, а его носитель — человек, переехавший оттуда и получивший прозвище «Шибаланский», то есть выходец из тех мест.

Самая правдоподобная версия происхождения корня «Шибал-» связана с глаголом «шибать» — бить, бросать, ударять. В старых русских говорах «шибала» — это задира, драчун, буян. Прозвище Шибала давали человеку с крутым нравом, любителю махать кулаками. От него образовались фамилии Шибалов, Шибалин, а также топоним Шибалово (такие деревни есть, например, в Вологодской и Костромской областях). Если село называлось Шибаланы, то его имя могло произойти от прозвища первопоселенца Шибала с типичным для восточнославянских названий суффиксом множественности -ан-.

Менее вероятная, но возможная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках есть слово «шибан» (иногда «шипан») — название одного из монгольских племён, вошедших в состав кочевых народов, либо личное имя Шибан. В таком случае фамилия указывала бы на родство с выходцем из этой среды. Однако для русского суффикса -ск- такое объяснение менее типично: фамилии на -ский от тюркских основ обычно возникали у дворянства или духовенства, а «Шибаланская» звучит скорее как крестьянская или мещанская, привязанная к конкретному месту.

Женская форма фамилии — Шибаланская — указывает на то, что мужская основа была Шибаланский. Такие фамилии встречаются в южных и центральных регионах России, особенно там, где была активна колонизация и возникали «выезжие» прозвища по месту прежнего жительства. Точных данных о сословной принадлежности носителей нет, но суффикс -ск- без дворянского контекста (отсутствие приставки фон-) чаще всего говорит о происхождении из среды крестьян или однодворцев, которые брали фамилии по названиям своих деревень.