Фамилия Шиборкина — женская форма фамилии Шиборкин, а та, в свою очередь, образована через суффикс -ин от прозвища или имени Шиборка. Ключевая особенность этой фамилии — неочевидная основа, которую не стоит путать с «шипением» или «шиворотом». Скорее всего, в её основе лежит диалектное слово или личное имя, бытовавшее в определённых регионах.

Разберём корень «шиб-». В русских говорах он связан с глаголом «шибать» — бить, ударять, кидать. Отсюда «шибкий» — быстрый, резкий, а «шибала» — буян, драчун. Прозвище Шиборка могло обозначать человека бойкого, резкого в движениях или вспыльчивого. Однако более правдоподобна версия, что это уменьшительная форма от дохристианского имени Шибор, которое фиксируется в древнерусских памятниках. Имя Шибор (как и Шибай, Шибан) было оберегом: считалось, что злые духи не тронут ребёнка с «некрасивым», грубоватым именем. Суффикс -ка в Шиборка — типичный для разговорной формы имени (ср. Ивашка, Федька), а уж от неё фамилия образовалась стандартно: «чей?» — Шиборкин.

Интересно, что суффикс -ин указывает на принадлежность конкретному человеку: Шиборкин — сын Шиборки. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин особенно распространены. В южных регионах чаще встречался бы вариант Шиборков (с суффиксом -ов), так что география фамилии сужается.

Встречается написание Шиборкина с буквой «ё» в ударении (Шиборкина), но произносится чаще с «о» под ударением. Родственные фамилии — Шибаев, Шибанов, Шибалин — все от того же корня «шиб-», но с разными суффиксами. Фамилия Шиборкина не относится к числу аристократических, её носители — скорее всего, крестьяне или посадские люди, получившие фамилию по имени отца в XVII–XIX веках. Встречается она редко, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска: если вы Шиборкина, ваши предки почти наверняка жили в одном из трёх-четырёх уездов центральной России.